พวกเขาค้นหาชั้นทางโบราณคดีรอบเพิงหิน El Gigante เพื่อหาซัง เมล็ดพืช หรือสิ่งอื่นใดที่อาจให้สารพันธุกรรม และทีมงานก็เริ่มทำงานเพื่อจัดลำดับตัวอย่างข้าวโพดอายุ 4,300 ปีของไซต์บางส่วน ซึ่งเป็นร่องรอยที่เก่าแก่ที่สุดของพืชผล ที่เอล จิกันเต้ กว่าสองปี ทีมงานพยายามจัดลำดับตัวอย่าง 30 ตัวอย่าง แต่มีเพียงสามตัวอย่างเท่านั้นที่มีคุณภาพเหมาะสมในการจัดลำดับจีโนมทั้งหมด ตัวอย่าง ประวัติศาสตร์ ทั้งสามตัวอย่างทั้งหมดมาจากชั้นล่าสุดของการยึดครองของเพิงหิน ซึ่งเป็นคาร์บอนที่มีอายุระหว่าง 2,300 ถึง 1,900 ปีที่แล้ว ด้วยจีโนมข้าวโพด 3 ลำดับจาก El Gigante นักวิจัยได้วิเคราะห์จีโนมเหล่านี้กับแผง 121 จีโนมของข้าวโพดหลากหลายสายพันธุ์ที่ตีพิมพ์ ซึ่งรวมถึง 12 มาจากซังและเมล็ดข้าวโพดโบราณ การเปรียบเทียบเผยให้เห็นตัวอย่างบางส่วนที่ทับซ้อนกันทางพันธุกรรมระหว่างตัวอย่างสามตัวอย่างจากที่กำบังหินในฮอนดูรัสและพันธุ์ข้าวโพดจากอเมริกาใต้