สาเหตุของซีสต์รังไข่ ถุงน้ำรังไข่เป็นถุงน้ำที่พัฒนาบนรังไข่อันเป็นผลมาจากการตกไข่ที่ผิดปกติ สิ่งนี้ทำให้เกิดการคั่งของของเหลวในรังไข่ ไข่ไม่ออกทำให้เกิดเป็นถุงน้ำขนาดเล็กที่รังไข่ทั้งสองข้างได้ นอกจากนี้ การเจริญเติบโตของเซลล์ที่ผิดปกติในรังไข่ยังทำให้เกิดซีสต์ได้บ่อยกว่าในอวัยวะอื่นๆ ในวัยหนุ่มสาว ซีสต์มักจะหายไปเอง แต่สำหรับผู้หญิงวัยหมดประจำเดือนอาจเป็นหรือไม่เป็นมะเร็งก็ได้ประเภทของซีสต์ ซีสต์รังไข่มี 5 ประเภท ซึ่งมักพบในผู้หญิงในช่วงวัยเจริญพันธุ์ตั้งแต่  รังไข่ 15-49 ปี ได้แก่ Functional Cyst เป็นซีสต์ที่พบได้บ่อยที่สุดในผู้หญิง ถุงน้ำหลายใบในรังไข่คือเมื่อรูขุมขนซึ่งมีหน้าที่ผลิตไข่ไม่แตกออกเพื่อปล่อยไข่ออกมา และของเหลวจะรวมตัวกันเป็นถุงน้ำ ภาวะเยื่อบุโพรงมดลูกเจริญผิดที่ (endometriosis)เป็นภาวะที่เนื้อเยื่อจากมดลูกเริ่มเติบโตในที่อื่น ๆ เช่นเดียวกับรังไข่ ทำให้เกิดอาการปวดอย่างรุนแรงและปัญหาภาวะเจริญพันธุ์