ขอบเขตของความหลากหลายทางชีวภาพที่มีอยู่ในทะเลสาบไบคาลนั้นเทียบเท่ากับทะเลสาบอื่น ๆ เพียงไม่กี่แห่ง ทะเลสาบไบคาลมีพืช 1,085 สายพันธุ์และสัตว์ 1,550 สายพันธุ์ สัตว์กว่า 60% เป็นสัตว์เฉพาะถิ่น เช่น ปลา 27 จาก 52 สายพันธุ์เป็นปลาเฉพาะถิ่น แมวน้ำไบคาล ( Phoca sibirica ) สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดเดียวที่อาศัยอยู่ในทะเลสาบ พบได้ทั่วบริเวณทะเลสาบ แต่ไม่มีที่อื่น สิ่งที่ควรทราบคือชนิดย่อยเฉพาะถิ่นของปลาโอมุล ( Coregonus autumnalis migratorius ) นำไปตกปลารมควัน และขายในตลาดทุกแห่งรอบทะเลสาบ สำหรับนักเดินทางหลายคนบนรถไฟสายทรานส์ไซบีเรีย การซื้อโอมุลรมควันเป็นหนึ่งในไฮไลท์ของการเดินทางไกล หมีและกวางสามารถสังเกตได้และ ทะเลสาบไบคาล ถูกล่าตามชายฝั่งไบคาล นิเวศวิทยา โรงงานผลิตเยื่อและกระดาษไบคาลสค์ ทะเลสาบไบคาลในฤดูร้อน เมื่อมองจากBolshoi Koty บนชายฝั่งตะวันตกเฉียงใต้ Baikalsk Pulp and Paper Mill (BPPM) สร้างขึ้นในปี 2509 โดยตรงบนแนวชายฝั่ง BPPM ฟอกกระดาษด้วยคลอรีนและปล่อยของเสียลงในไบคาล แม้จะมีการประท้วงมากมายแต่ BPPM ก็ยังคงดำเนินการอยู่ นักเคลื่อนไหวด้านสิ่งแวดล้อมกำลังดิ้นรนเพื่อทำให้มลพิษมีอันตรายน้อยลงแทนที่จะยุติการผลิตของ BPPM เนื่องจากการปิดโรงงานอาจเป็นปัญหาเนื่องจากปัญหาทางเศรษฐกิจและสังคมในท้องถิ่น